・人為的な原因としては工場等で有害物質を使用・貯蔵等していて、その物質が流出・揮散・飛散・漏洩したり、埋め立てられたりすることで、土壌が汚染されるケースなどが考えられます。

・人為的な原因がなくても第２種特定有害物質(シアン化合物を除く)については元来その土地に自然由来で有害物質が含まれていることなども原因として考えられます。

・現在、有害物質が排出されていなくても過去に有害物質が排出されていれば、その有害物質が自然に浄化されることなく現在も悪影響を及ぼしている可能性も十分に考えられます。

土の中の有害物質は水中や大気中のように簡単に移動することがない為、汚染された場所に長期的に留まり、人の健康・動植物・生態系に長期間にわたり悪影響を及ぼします。
また目視で確認することが困難な場合が多く、汚染に気付きにくいということも特徴のひとつです。